李栋  博士

教授

2002-2006年      浙江大学，光电信息工程学系 学士

2006-2011年      香港科技大学，电子与计算机工程学系 博士

2011-2015年      霍华德∙休斯医学研究所，Janelia研究校园 博士后

2015-2024年      中国科学院生物物理研究所 研究员

2024年-              清华大学生命科学学院 教授，博士生导师

●  研究兴趣、领域：

光学显微成像技术已成为生命科学研究中必不可少的共性关键技术，其革新一直是生物医学领域发展的重要驱动力。近年来以超分辨显微镜，单分子成像与追踪，以及多光子非线性显微成像为代表的技术革新，为生命科学发展带来了新的契机。李栋课题组致力于光学显微成像技术的研制与应用工作，先后开发了:（1）条纹激活非线性结构光显微镜; （2）掠入射结构光超分辨显微镜;（3）合理化深度学习超分辨成像框架等技术方法，并利用这些新型成像技术开展细胞与发育生物学研究，可在高时空分辨率下连续捕捉细胞内生物过程的动态分子事件，提供与测序、生化、质谱等方法相互补的时空动态信息。

●  代表性论文：

1. Qiao C^#, Chen H^#, Wang R^#, Jiang T, Wang Y, Li D*. Deep learning-based optical aberration estimation enables offline digital adaptive optics and super-resolution imaging. Photonics Research, 2024 Mar; 12(3):474-484. Cover article.

2. Qiao C^#, Zeng Y^#, Meng Q^#, Chen X^#, Chen H, Jiang T, Wei R, Guo J, Fu W, Lu H, Li D, Wang Y, Qiao H, Wu J, Li D*, Dai Q*. Zero-shot learning enables instant denoising and super-resolution in optical fluorescence microscopy. Nature Communications, 2024 May; 15(1):4180.

3. Qiao C^#, Li D^#, Liu Y^#, Zhang S^#, Liu K, Liu C, Guo Y, Jiang T, Fang C, Li N, Zeng Y, He K, Zhu X, Lippincott-Schwartz J*, Dai Q*, Li D*. Rationalized deep learning super-resolution microscopy for sustained live imaging of rapid subcellular processes. Nature Biotechnology, 2023 Mar; 41(3):367-377. Cover article.

4. Gong B^#, Guo Y^#, Ding S, Liu X, Meng A, Li D*, Jia S*, A Golgi-derived vesicle potentiates PtdIns4P to PtdIns3P conversion for endosome fission. Nature Cell Biology, 2021 Jul; 23(7):782-795.

5. Xu G^#, Liu C^#, Zhou S^#, Li Q, Feng Y, Sun P, Feng H, Gao Y, Zhu J, Luo X, Zhan Q, Liu S, Zhu S, Deng H*, Li D*, Gao P*. Viral tegument proteins restrict cGAS-DNA phase separation to mediate immune evasion. Molecular Cell, 2021 Jul 1;81(13):2823-2837.

6. Li D^#, Colin-York H^#, Barbieri L^#, Javanmardi Y^#, Guo Y, Korobchevskaya K, Moeendarbary E*, Li D*, Fritzsche M*. Astigmatic traction force microscopy (aTFM). Nature Communications, 2021 Apr 12; 12(1):2168.

7. Qiao C^#, Li D^#, Guo Y^#, Liu C^#, Jiang T, Dai Q*, Li D*. Evaluation and development of deep neural networks for image super-resolution in optical microscopy. Nature Methods, 2021 Feb;18(2):194-202.

8. Wang X^#*, Liu C^#, Zhang S^#, Yan H, Zhang L, Jiang A, Liu Y, Feng Y, Li D, Guo Y, Hu X, Lin Y, Bu P, Li D*. N6-methyladenosine modification of MALAT1 promotes metastasis via reshaping nuclear speckles. Developmental Cell, 2021 Mar 8;56(5):702-715.

9. Qin J, Guo Y, Xue B, Shi P, Chen Y, Su Q, Hao H, Zhao S, Wu C, Yu L, Li D*, Sun Y*. ER-mitochondria contacts promote mtDNA nucleoids active transportation via mitochondrial dynamic tubulation. Nature Communications, 2020 Sep 8;11(1):4471.

10. Li D^#, Zhao Y^#, Li D, Zhao H, Huang J, Miao G, Feng D, Liu P, Li D*, Zhang H *. The ER-Localized Protein DFCP1 Modulates ER-Lipid Droplet Contact Formation. Cell Reports, 2019 Apr 9;27(2):343-358.

11. Guo Y^#,Li D^#, Zhang S, Yang Y, Liu JJ, Wang X, Liu C, Milkie DE, Moore RP, Tulu US, Kiehart DP, Hu J, Lippincott-Schwartz J*, Betzig E*, Li D*. Visualizing intracellular organelle and cytoskeletal interactions at nanoscale resolution on millisecond timescales. Cell, 2018 Nov 15;175(5):1430-1442

12. Li D, Shao L, Chen BC, Zhang X, Zhang M, Moses B, Milkie DE, Beach JR, Hammer JA, Pasham M, Kirchhausen T, Baird MA, Davidson MW, Xu P, Betzig E*. Extended-resolution structured illumination imaging of endocytic and cytoskeletal dynamics. Science, 2015 Aug 28;349(6251): aab3500. Cover article.

●  荣誉、奖励：

2021年，中国科学院优秀青年科学家奖

2020年，中国科学院优秀导师奖

2019年，掠入射结构光超分辨成像技术发展与应用（Cell, 2018）入选年度中国十大科学进展

2019年，科学探索奖，腾讯基金会

2019年，中源协和生命医学创新突破奖

2015年， PicoQuant 青年研究员奖，国际光学工程学会(SPIE)

2011年， 青年科学家奖获奖者，香港科学会

●  联系方式：

Email：li-dong@tsinghua.edu.cn