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半岛·体育中国官方网站平台登陆吝易、杨雪瑞团队揭示相分离调控节律性蛋白翻译的分子机制

“朝搴阰之木兰兮，夕揽洲之宿莽。”（屈原，《离骚》），“晨兴理荒秽，带月荷锄归”（陶渊明《归园田居·其三》）。地球自转造就日月流转，昼夜更替。为适应这种规律，在宏观层面上，人类活动在时间和空间上随昼夜变化；而在微观层面上，细胞中的众多生物过程也随着昼夜节律在时间和空间上被严格调控，通过精妙地协调多种生物过程的振荡形成无形的生物钟。2023年 6月26日，清华大学生命科学学院、清华-IDG/麦戈文脑科学研究院...

15 Jun

半岛·体育中国官方网站平台登陆方晓峰与合作者应邀综述相分离对植物转录和染色质区室化的重要调控作用

细胞内各种生化反应的不同成分的区隔和交换对于维持细胞活动的精细调节至关重要。相比有膜细胞器，无膜细胞器（MLO）更为广泛地存在于细胞质、细胞核和许多其他膜细胞器中。越来越多的证据表明，相分离与很多重要的基础生命活动密切相关，在基因表达调控、细胞生长发育、信号转导、胁迫响应、细胞结构等方面发挥了重要的生物学功能。尽管，相分离在转录调控以及染色质结构调控中的作用机制主要来自于动物和酵母中的研究，近年来...

12 Jun

化学系张新荣、张四纯与半岛·体育中国官方网站平台登陆刘俊杰实验室合作开发基于gRNA细胞内甲基化的可调控…

CRISPR-Cas系统作为细菌和古菌抵御外源病毒入侵的适应性免疫系统，因其核酸酶和可编程靶向的特点被开发成基因编辑工具并广泛应用。然而，天然的CRISPR-Cas9、CRISPR-Cas12a等基因编辑工具存在着体内无法在“时间”和“空间”上被精确控制应用的限制，因此研究者们为了解决这一问题，开发了一系列外源性、可诱导型的CRISPR-Cas基因编辑工具，例如通过蓝光和小分子药物对体内的CRISPR-Cas系统进行“开(on)和关(off)”。但是，这些...

12 Jun

自私的基因！刘俊杰课题组揭示逆转座子在基因组上跳跃的分子机制

逆转座子是一类可以通过“复制-粘贴”的方式在基因组上发生跳跃的DNA元件。R2是低等真核生物中广泛存在的一种逆转座子。它们专一性地“寄生”在宿主基因组的28S核糖体DNA中，借助宿主基因的启动子，合成自身的mRNA和蛋白质并组装形成R2复合物（“复制”过程）；R2复合物可再次识别宿主28S核糖体DNA上的专一性位点，通过核酸酶（endonuclease, EN）结构域切开DNA双链，再通过逆转录酶（reverse transcriptase, RT）结构域逆转录...

05 Jun

齐岭、吝易实验室揭示脂肪细胞内质网中错误折叠的蛋白处理新机制

细胞通过各种不同的蛋白质量控制机制（Protein Quality Control Mechanisms）防止有害蛋白聚集。这些蛋白质量控制机制的退化或故障导致众多人类疾病，如糖尿病、癌症，和各种老年疾病等。内质网作为蛋白质折叠和质量控制的主要场所，利用内质网蛋白降解 (ERAD) 和内质网自噬（ER-phagy）两种机制降解错误蛋白。其中ERAD 有针对性地降解内质网中的蛋白，而ER-phagy，作为自噬 (autophagy) 的一种，常被认为批量降解已碎片化的...

02 Jun

隋森芳院士团队在Nature上发文揭示核孔复合体转运核糖体前体的分子机制

NPC（核孔复合体）是细胞内最庞大、最复杂的分子机器之一，是介导生物大分子进行核质转运的唯一通道，参与细胞内众多重要的生命活动，其功能的紊乱能够引起包括癌症在内的多种严重的疾病。近年来，通过整合冷冻电镜技术、X射线晶体学、质谱学和人工智能等技术，NPC的三维结构正在逐步得到解析。然而，关于其核质转运的分子机制仍然是不清楚的。核糖体是NPC转运的最具代表性的生物大分子组装体之一，负责合成生命的基础物质-蛋...

25 May

半岛·体育中国官方网站平台登陆颉伟组应邀在TiBS发表关于增强子激活、失活和沉默的综述

2023年5月21日，清华大学半岛·体育中国官方网站平台登陆颉伟课题组在《Trends in Biochemical Sciences》期刊发表了题为“Activation, decommissioning, and dememorization: enhancers in a life cycle”的综述。

16 May

江鹏课题组与合作者揭示肿瘤来源延胡索酸的免疫抑制功能

2023年5月12日，清华大学半岛·体育中国官方网站平台登陆江鹏课题组, 与武汉科技大学祝海川课题组和北京大学张新祥课题组合作，在《细胞代谢》（Cell Metabolism）杂志上以Article的形式发表了题为“肿瘤细胞来源的延胡索酸抑制肿瘤微环境中CD8+ T细胞的抗肿瘤功能”的研究论文。

13 May

李赛课题组总结cryo-ET的技术突破及其带来的分辨率革命

冷冻电子断层成像（cryo-ET）是在原位环境下发现并解析新结构，实现跨尺度生物成像的重要结构生物学手段。近年来cryo-ET领域蓬勃发展：一方面，cryo-ET数据采集及后续数据处理方法的技术革新带来了分辨率的革命性突破；另一方面，细胞环境下的目标识别技术及减薄冷冻细胞样品技术的发展，使在10万倍放大倍数下直接观察生理条件下细胞内的生物学过程成为可能。这两方面的革新相辅相成，极大地促进了在宿主细胞中原位高分辨观测病...

28 Apr

半岛·体育中国官方网站平台登陆张强锋课题组开发冷冻电镜密度图分辨率估计的人工智能算法

冷冻电镜已成为解析生物大分子结构的最主要技术之一。在冷冻电镜密度图的质量评估中，一个关键的指标是分辨率，即可以通过一致性测试的最精细结构细节的大小。由于样品异质性和辐射损伤等因素的影响，冷冻电镜密度图在不同区域的分辨率是可以不同的；因此，研究者因此引入了局部分辨率的概念。快速、准确、有效地评估冷冻电镜密度图的局部分辨率可以为三维重构和下游结构分析提供指导。目前可用的局部分辨率估计方法存在一些限...